Variante do coronavírus: por que o Japão descobriu antes do Brasil a linhagem do vírus vindaaplicativo betano como funcionaManaus:aplicativo betano como funciona

O virologista Felipe Naveca, pesquisador do Instituto Leônidas & Maria Deane (ILMD/Fiocruz Amazônia), referência na análise genômica no Amazonas, onde foi identificada a variante que tem preocupado especialistas, afirma que não existe uma rotina diáriaaplicativo betano como funcionasequenciamento genético na região.

"Para fazer isso teríamos que ter uma equipe dedicada só ao sequenciamento, com automação e investimentos muito maiores do que há hoje", diz ele.

"Caso contrário, todo o recurso acabariaaplicativo betano como funciona3 meses, quando a nossa proposta é sequenciar durante o maior tempo possível e mostrar as mudanças ao longo desse tempo."

Em paralelo ao processamentoaplicativo betano como funcionadiagnósticosaplicativo betano como funcionatestesaplicativo betano como funcionaPCR, também feito no instituto, a equipe sequencia 96 genomasaplicativo betano como funcionaalta qualidade a cada duas ou três semanas.

A África do Sul, que tem cercaaplicativo betano como funcionaum quarto da população brasileira e tem sido considerado um exemplo bem sucedidoaplicativo betano como funcionavigilância, sequencia entre 50 e 100 genomasaplicativo betano como funcionacoronavírus por semana.

O Reino Unido faz cercaaplicativo betano como funciona10 mil sequenciamentos por semana e se prepara para dobrar esse número nos próximos meses. O país temaplicativo betano como funcionalonge a maior capacidadeaplicativo betano como funcionaprocessamento, respondendo por cercaaplicativo betano como funciona200 mil entre os 400 mil genomas compartilhados por cientistasaplicativo betano como funcionatodo o mundo na plataforma Gisaid.

Concorrência entre sequenciamento e examesaplicativo betano como funcionaPCR

Não existem dados consolidados sobre o volume sequenciado por semana no país ou a capacidadeaplicativo betano como funcionaprocessamento.

Existem algumas iniciativas que caminhamaplicativo betano como funcionaparalelo — uma delas é a rede genômica da Fiocruz, que conta com instituiçõesaplicativo betano como funciona11 Estados e analisa amostrasaplicativo betano como funcionatodo o país.

A chefe do Laboratórioaplicativo betano como funcionaVírus Respiratórios e Sarampo do Instituto Oswaldo Cruz (IOC/Fiocruz), Marilda Siqueira, que atua como Centroaplicativo betano como funcionaReferência Nacionalaplicativo betano como funcionavírus respiratórios junto ao Ministério da Saúde, afirma que os laboratórios da rede têm realizado sequenciamentos desde o início da pandemia — uma expertise que vemaplicativo betano como funcionaparte da vigilância genômica do vírus influenza feita há anos pelo grupo.

Dada a gravidade da pandemia no país, entretanto, o trabalho tem muitas vezesaplicativo betano como funcionaser dividido com o processamentoaplicativo betano como funcionaexames diagnósticosaplicativo betano como funcionaPCR - por isso o volumeaplicativo betano como funcionaanálises genômicas é inferior ao que as equipes desejariam.

Ainda assim, ressalta Marilda, o Brasil responde por cercaaplicativo betano como funciona2,4 mil dos 5 mil genomas do Sars-CoV-2 cadastrados pela América do Sul na plataforma Gisaid.

"A gente não está tão ruim assim quando se pensaaplicativo betano como funcionaregião. Temos, claro, que melhorar, e estamos buscando essa melhora."

O esforço agora, diz ela, é para que a vigilância genômica do coronavírus sejaaplicativo betano como funcionatempo real, para que o país conheça as variantes que circulam no territórioaplicativo betano como funcionaforma mais rápida e os gestoresaplicativo betano como funcionasaúde possam "se antecipar" para tentar controlar, por exemplo, a disseminaçãoaplicativo betano como funcionalinhagens que sejam mais transmissíveis.

Para isso, é preciso aumentar o númeroaplicativo betano como funcionaamostras sequenciadas e estruturar uma logística que garanta a análise sistemáticaaplicativo betano como funcionadadosaplicativo betano como funcionatoda as regiões do país.

A linhagem descobertaaplicativo betano como funcionaManaus, que tem preocupado cientistasaplicativo betano como funcionatodo o mundo, tornou esse avanço ainda mais premente, mas o esforço para tentar ampliar a análise genômica das amostras do país é anterior, diz a pesquisadora.

Reagentes cotadosaplicativo betano como funcionadólar

Em outra frente, o Brasil conta com a ajudaaplicativo betano como funcionaum dos 300 supercomputadores mais potentes do mundo — o SDumont, que fica no Laboratório Nacionalaplicativo betano como funcionaComputação Científica (LNCC),aplicativo betano como funcionaPetrópolis (RJ).

Lá, a pesquisadora Ana Tereza Ribeiroaplicativo betano como funcionaVasconcelos, responsável pelo Laboratórioaplicativo betano como funcionaBioinformática do LNCC, eaplicativo betano como funcionaequipeaplicativo betano como funciona25 pesquisadores fazem o sequenciamentoaplicativo betano como funcionaamostras do Rioaplicativo betano como funcionaJaneiro eaplicativo betano como funcionaoutras regiões do país.

Do início da pandemia até o momento, foram feitos cercaaplicativo betano como funciona400 sequenciamentos, um número bem abaixo do que a cientista gostaria.

O principal gargalo, diz ela, é verba.

"Estrutura física o Brasil tem, pessoal qualificado, também — trabalhamosaplicativo betano como funcionarede genômica há 20, 30 anos", afirma. "A gente precisaaplicativo betano como funcionamais recursos para custeio, para comprar reagentes e ter acesso às amostras das diferentes regiões do país."

Os reagentes usados no processoaplicativo betano como funcionasequenciamento são importados — e passaram a custar bem mais com a desvalorização do real nos últimos meses.

Antes disso, entretanto, a vigilância genômica já havia sido impactada pelos cortes sucessivos que o orçamento da Ciência e Tecnologia vem sofrendo no país pelo menos desde 2016.

"E vigilância genômica é algo que temaplicativo betano como funcionaser constante, a ideia é antever o que vai acontecer", pontua Ana Tereza.

A burocracia brasileira para aprovação e liberaçãoaplicativo betano como funcionarecursos

O virologista Fernando Spilki, professor da Feevale, diz que o Brasil tem condiçõesaplicativo betano como funciona"recuperar o terreno perdido" nessa área daqui para frente, com a liberaçãoaplicativo betano como funcionarecursos para pesquisas relacionadas à covid-19.

Ele está à frente da rede Corona-ômica BR MCTIC/Finep, um grande projetoaplicativo betano como funcionasequenciamento do Sars-CoV-2 que começou a ser desenhadoaplicativo betano como funcionafevereiro do ano passado e recebeu a primeira parte do financiamento — que vai chegar no total a cercaaplicativo betano como funcionaR$ 10 milhões — entre setembro e outubro.

A demora para liberaçãoaplicativo betano como funcionarecursos, segundo ele, não é exclusividade do momento atual, mas "a rotina do pesquisador brasileiro".

A rede conta no momento com 14 instituições associadas, com 30 bolsistas CNPQ e mais uma centenaaplicativo betano como funcionapesquisadores. Um dos objetivos é mapear as linhagens do coronavírus que estão circulandoaplicativo betano como funcionaalgumas regiões do país e entender o significado práticoaplicativo betano como funcionaalgumas mutações.

Comentando sobre o esforço dos cientistas do país na áreaaplicativo betano como funcionavigilância genômica do coronavírus, o virologista acrescenta que a nova variante que circulaaplicativo betano como funcionaManaus foi detectada primeiro no Japão e não no Brasil "por uma questãoaplicativo betano como funcionahoras".

Ele se refere ao trabalho dos cientistas do Centro Brasil-Reino Unidoaplicativo betano como funcionaDescoberta, Diagnóstico, Genômica e Epidemiologiaaplicativo betano como funcionaArbovírus (grupo Cadde), que publicaram dois dias depois da notificação das autoridades japonesas um estudo preliminaraplicativo betano como funcionaque detalhavam a variante.

O grupo, que também tem se dedicado a acompanhar por meio da análise genética a evolução do coronavírus, é coordenado pela imunologista Ester Sabino, pesquisadora do Institutoaplicativo betano como funcionaMedicina Tropical da Faculdadeaplicativo betano como funcionaMedicina da USP, que também esteve à frente do primeiro sequenciamento do genoma do Sars-CoV-2 realizado no país,aplicativo betano como funcionafevereiroaplicativo betano como funciona2020.

Já o Japão não está entre os 10 países que mais têm feito sequenciamento do genoma do vírusaplicativo betano como funcionaproporção ao totalaplicativo betano como funcionainfectados, mas tem realizado uma políticaaplicativo betano como funcionavigilância epidemiológica ativaaplicativo betano como funcionaseus aeroportos na tentativaaplicativo betano como funcionaevitar um aumento explosivo no númeroaplicativo betano como funcionacasos da doença.

A grande maioria dos aeroportos conta há meses com "estaçõesaplicativo betano como funcionaquarentena", para onde são enviados os viajantes com diagnóstico positivo para covid.

O país realiza testesaplicativo betano como funcionamassa nos turistas e residentes que chegam do exterior — daí a razão por que identificou com rapidez a variante que circula no Amazonas.

O Brasil, poraplicativo betano como funcionavez, não faz vigilância epidemiológica ativa nos aeroportos. As medidas estão mais rígidas desde o dia 31aplicativo betano como funcionadezembro, quando o país passou a exigir dos passageirosaplicativo betano como funcionavoos internacionais um comprovanteaplicativo betano como funcionadiagnóstico negativo da doençaaplicativo betano como funcionaaté 72 horas antes do embarque.

Antes disso, contudo, havia protocolos para casos suspeitos, mas, como se sabe, uma grande quantidadeaplicativo betano como funcionacasosaplicativo betano como funcionacovid-19 é assintomática.

O 'padrão ouro' do Reino Unido

O Reino Unido realiza hoje o maior número diárioaplicativo betano como funcionasequenciamentos do genoma do coronavírus e tem uma estrutura única, que conta com o trabalho diretoaplicativo betano como funcionacercaaplicativo betano como funciona400 pessoas.

O diretoraplicativo betano como funcionaestratégia da força-tarefa, batizadaaplicativo betano como funcionaCovid-19 Genomics UK Consortium (COG-UK), Ewan Harrison, conta que a equipe vai muito além dos cientistas e envolve uma grande operação logística,aplicativo betano como funcionaque caminhões transportam diariamente amostras do vírus coletadasaplicativo betano como funcionatodo o país para os 16 hubsaplicativo betano como funcionasequenciamento.

A história começouaplicativo betano como funciona4aplicativo betano como funcionamarço, diante da preocupação entre especialistasaplicativo betano como funcionagenomasaplicativo betano como funcionapatógenos com a rápida expansão da covid-19 no país.

Menosaplicativo betano como funcionaduas semanas depois, após dias seguidosaplicativo betano como funcionareuniões, o grupo formalizou uma proposta e a apresentou ao governo e a organismosaplicativo betano como funcionafomento.

Naquele momento, alguns críticos ao projeto argumentavam que os coronavírus mutavam menos do que muitos outros, como o influenza e o HIV, e que o esforço, portanto, seria uma perdaaplicativo betano como funcionatempo.

Parte deles não imaginava, entretanto, que o vírus infectaria milhõesaplicativo betano como funcionapessoas, o que acabou abrindo portas para a ocorrênciaaplicativo betano como funcionauma sérieaplicativo betano como funcionamutações.

"Quando o vírus se replica, quando faz uma cópiaaplicativo betano como funcionasi mesmo (de seu material genético), ele ocasionalmente comete erros", explica o microbiologista Ewan Harrison, ligado à Universidadeaplicativo betano como funcionaCambridge e ao Covid-19 Genomics UK Consortium.

"Quanto mais vírus circulando, maior a probabilidadeaplicativo betano como funcionaisso acontecer. Quanto mais longas as infecções, maiores as chancesaplicativo betano como funcionao vírus desenvolver uma mutação."

Naquele momento, o consórcio obteve um financiamentoaplicativo betano como funciona20 milhõesaplicativo betano como funcionalibras (cercaaplicativo betano como funcionaR$ 147 milhões) e acabouaplicativo betano como funcionaver aprovado um aporte adicionalaplicativo betano como funciona12 milhões (R$ 88 milhões), que será usadoaplicativo betano como funcionaparte para expandir a capacidadeaplicativo betano como funcionasequenciamentos por semana para 20 mil e, posteriormente, para 30 mil.

"Nós nunca fizemos o sequenciamento genéticoaplicativo betano como funcionaum patógeno nessa escala,aplicativo betano como funcionatão curto períodoaplicativo betano como funcionatempo. O que temos visto é a evoluçãoaplicativo betano como funcionaação", acrescenta Harrison.

"Isso só reforça o fatoaplicativo betano como funcionaque precisamos manter o númeroaplicativo betano como funcionacasos sob controle, temos que manter as medidas para tentar conter o vírus — usar máscaras, manter o distanciamento social, a higiene das mãos", completa.

No caso da variante identificada no país, o cientista conta que o consórcio foi notificado no inícioaplicativo betano como funcionadezembro sobre um aumento súbitoaplicativo betano como funcionacasosaplicativo betano como funcionaLondres e no sudeste do Reino Unido. A partir daí, os pesquisadores foram buscar no bancoaplicativo betano como funcionagenomas amostras daquela região para entender se havia algo diferente.

Foi aí que descobriram a B117, que tem 24 mutações, 13 que afetam a espícula, que está associada à entrada do vírus na célula do hospedeiro. Há indicativosaplicativo betano como funcionaque as mutações tenham tornado essa cepa mais contagiosa, mas não há indíciosaplicativo betano como funcionaque ela leve a quadros mais gravesaplicativo betano como funcionacovid-19.

A varianteaplicativo betano como funcionaManaus

A virologista italiana Marta Giovanetti, que desde 2016 realiza pesquisas no Brasil e tem se dedicado à vigilância genômica do Sars-CoV-2 aqui, ressalta que o modelo britânico é um ponto fora da curva.

Para ela, a resposta do Brasil foi mais interessante do que aaplicativo betano como funcionaseu país, que só mais recentemente passou a sequenciar mais genomas e a "produzir mais conhecimento".

"A gente viu que as regiões mais afetadas (na Itália) geraram genomas na ordemaplicativo betano como funcionacentenas. Isso não descreve a realidade do que aconteceu, não permite realizar algum tipoaplicativo betano como funcionainferência", afirma.

"Isso foi um pouco diferente no Brasil — lógico que poderia ser bem melhor", completa.

Assim como a variante identificada no Reino Unido e na África do Sul, a encontradaaplicativo betano como funcionaManaus apresentou mutações nos genes que codificam a espícula, a proteína que permite a entrada do vírus nas células humanas — e que pode indicar um aumento na transmissibilidade do vírus.

Os dados analisados indicam que ela surgiu entre novembro e dezembro, diz Naveca, do Instituto Leônidas & Maria Deane (ILMD/Fiocruz Amazônia). O pesquisador espera aumentar o númeroaplicativo betano como funcionasequenciamentos para identificar se a nova linhagem está circulandoaplicativo betano como funcionatodo Estado e,aplicativo betano como funcionacaso positivo, com qual frequência. Por enquanto, não há dados sobre a circulação da variante no restante do país.

Para Naveca, por mais que a evolução do vírus seja esperada, a nova cepa encontrada no Reino Unido, na África do Sul e, agora, no Brasil chamam atenção.

"Elas acumularam muitas mutaçõesaplicativo betano como funcionapouco tempo, acima do que a gente estava vendo até o momento."

Ainda assim, as razões por trás da explosão no númeroaplicativo betano como funcionacasos no Amazonas ainda precisam ser melhor estudadas, diz o pesquisador, já que a explicação pode ser multifatorial.

Além da variante que pode ser mais contagiosa, a região entrouaplicativo betano como funcionanovembro na temporadaaplicativo betano como funcionavírus respiratórios, com o "inverno amazônico", e ainda reduziu o distanciamento social no períodoaplicativo betano como funcionafestas.

Por isso, o cientista faz um apelo aos brasileiros para que sigam as recomendações para tentar evitar a disseminação do vírus no país.

"O vírus mutante não atravessa a máscara, não resiste à lavagem das mãos com água e sabão, ao usoaplicativo betano como funcionaálcool gel. A transmissão também é evitada com o distanciamento social."

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